О господи причем тут вайн и причем тут прокси? И на кой ляд тащить говно программы из винды в линукс? Линукс то вам зачем? Более того ничего в клиенте менять не стоило иначе придется менять все назад снова в винде. Прокси же указываются в системе глобально и никакой левый софт не нужен. В консоли от рута наберите подставив свои данные:
export http_proxy='http://логин:пароль@ip_прокси:порт_ рокси/'
export ftp_proxy='http://логин:пароль@ip_прокси:порт_ рокси/'
Чтобы не вводить каждый раз при старте системы достаточно например вписать это в файл .bashrc в домашнем каталоге (точка указывает на то что файл скрытый), или в настройках вашей вм.
Но раз задаете такие вопросы подумайте ещё раз нужен ли вам линукс...
