Обычно это бывает, когда пользователь хочет отправить из кошелька всю имеющуюся в нем сумму, не учитывая, что система WebMoney должна получить свою комиссию за транзакцию в размере 0,8% от отправляемой суммы. Например, чтобы отправить 50 WMZ, необходимо иметь в кошельке 50x1,008 = 50,40 WMZ.
Если платеж все-таки ушел с твоего кошелька, но не пришел на баланс сайта, то через историю кошелька достань форму перевода и пошли смс на WMID на который посылал деньги и узнай, что с платежом.
Зы Вот тарифы на комиссию внутри системы WM http://www.webmoney.ru/rus/about/fees/index.shtml