у второго пати это боссы тоже будут мертвы
Да, тоже будут мертвы

То что вы называете КД - идентификатор сохраненного состояния подземелья. При следующем входе в это подземелье с этим идентификатором оно будет в том состоянии, в котором его оставила предыдущая группа, не зависимо от того, кто в нее входил. Простые мобы естественно могут респавнуться, если прошло достаточное количество времени