Другие игроки после слияния не жаловались на проблему потери репутации/предметов. Почему вы уверенны что проблема именно в этом?
Не думаю что вам смогут помочь с этим в баг трекере, так как проблема носит скорее частный характер конкретного персонажа.
первый чоппер был сделан для себя, так что и рец и чоппер уже давно выучены.
Вот линк на предмет с вовхеда. Введите его в игровой чат и нажмите на название.
Если на нем не будет надписи "уже известно" то предмет точно можно будет изучить еще раз, приобретя его у других игроков.
Код:
/script DEFAULT_CHAT_FRAME:AddMessage("\124cffa335ee\124Hitem:44413::::::::120:::::\124h[Анжинерский чоппер]\124h\124r");
На счет рецепта. Возможно "забыть" рецепт поможет сброс профессии с последующим изучением ее с нуля. Но обычно сброс вызывает больше проблем чем пользы. Решайте сами.