отцепи кулер от материнки и подключи его на 12в от блока питания(чёрный "земля/0" жёлтый "+12") есть там разъёмы пустые у бп, чаще всего белые, на 4 контакта, будет постоянно на максимуме крутить пока регулятор не приделаешь(схем в инете полно - справится даже инвалид)
так и не понял до конца проблему? кулер стопорится после того как немного поработает когда пк врубается? возможно питающая кулер цепь глючит